生存分析又称时间-事件分析，是临床研究中常用的统计分析方法。但是哪些研究或者数据可以进行生存分析，如何选择不同的分析方法，如何使用R语言进行分析和作图？可能很多医生都不知道。在第四个时期
“临床医生做科研——通向成功的阶梯”
在公益培训班上，解放军总医院第五医学中心的董纪教授这样解释。
解放军总医院第五医学中心
杨勇平教授
主持了这个在线培训课程，
董纪教授
教新内容之前，先讲解第三期的作业。然后以团队在JOH上发表的生存分析研究为例，总结了临床路径和方法，演示了R语言操作流程。此外，中国中医科学院中药研究所中医理论与本草文献研究中心副主任
张燕琼博士
受邀分享基于药物重新定位策略的抗肝癌候选中成药发现研究。
演讲者介绍
一、什么是生存分析？生存分析又称时间-时间对事件分析，是一种将末端事件的发生与时间的经历相结合的统计分析方法。它的主要特点是考虑到了每个研究对象在到达某个终点时所经历的时间的长度。同时，结束事件、截断(也称为丢失访问或删除)和存活时间是
需要掌握的三个基本概念。
终端事件(终端事件)
指研究者指定的生存终点时间。在生存分析中，终点事件是一个非常重要的概念，它的定义应该尽可能清晰。狭义终点事件是指生存或死亡，而广义终点事件包括治愈、疾病改善、肿瘤发生等两类事件。带有结束事件的数据称为完全数据，提供精确生存时间。
审查也称为遗漏或删除。
，是指在随访研究中，在规定的观察期内，部分观察对象由于各种原因没有观察到终点事件的发生，不知道确切的存活情况时间。截断的数据称为删失数据或删除数据。因为它不能提供准确的生存时间，也就是所谓的不完全数据。截断原因是患者失访，患者生存时间超过研究终止期。但是删失数据的价值在于提供观察期内的信息。生存时间不会比观察时间短。截断的数据往往在其右上角标有“”，表示真实存活时间未知，只知道比观测存活长时间。
存活时间时间(存活时间)
可以广义定义为从规定的观测起点到特定终点事件发生的时间的长度。它的三个要素是
观察起点(起点时间)、终点事件(终点时间)和时间度量(终点时间-起点时间)
观察事件的起点和终点根据研究目的确定。随机临床试验的观察起点通常是随机的时间；在观察性研究中，观察的起点可以是发病时间，初诊时间，或接受正规治疗者时间等。存活的计量单位时间可以是年、月、日、小时等。生存时间不服从正态分布，常表现为指数分布、威布尔分布、对数正态分布、对数物流分布、伽玛分布或更复杂的分布，需要特殊的统计方法。
二、如何选择分析方法？临床医生在设计生存分析研究时需要考虑。
PICOT的五个基本元素
，分别是患者(患者/人群/问题，P)、干预(I，可选)、比较(C)、结果(O)和时间(时间，T)。有了这些基本要素，就可以进行生存分析了。生存分析包括
三种常用的统计分析方法
，包括生命表、Kaplan-Meier和Cox回归。
生命表法
用来分析群体的生存数据，找出不同群体的存活率。或者当样本量较大(如n > 50)时，可将数据按不同的段分成若干组时间，观察不同点的存活率时间。由于这种方法是以表格形式呈现的，不够直观，所以在临床上应用并不广泛，通常被流行病学研究机构采用。
卡普兰-迈耶方法
当样本量较小时，无法给出具体时间点的存活率，这样就不用担心每个时间段只有几个观测值甚至没有观测值的尴尬局面了。这是一种单因素分析方法。
考克斯回归
拟合Cox比例风险模型是生存分析中最重要的方法，也是多因素分析中最常用的方法。
根据研究中两组数据是否平衡，可以选择不同的生存分析方法。两组间的平衡，如前瞻性随机对照研究，可选择单因素比较、Kaplan-Meier和单因素Cox回归。两组间的不平衡，如死亡相关因素的回顾性分析，可采用单因素比较、Kaplan-Meier初步筛选变量和多变量Cox回归。
3.如何使用R语言？董纪教授已经在小组中发表了
肝病杂志(JOH)
以论文《恩替卡韦+鳖甲软肝片降低中国慢乙肝HCC风险》(译名)(图1)为例，介绍了研究设计思路，阐述了其中涉及的生存分析的概念和方法，并以此研究数据为基础，演示了如何使用统计工具R语言进行生存曲线分析和Cox回归分析及绘制。具体的R语言代码见图2。
图一。生存分析案例研究
图二。r语言脚本
该作业使用lung(生存包中包含的数据集)来绘制生存曲线，如下所示。
特别说明：
示例数据和r语言代码
，可通过链接下载：链接：https://pan.baidu.com/s/1Qw9ueUTaaph8XI3Eh1oI8g PWD=1234，提取代码：1234。
特别提醒
可以加学术助理，
备注：临床医生做科研，拉你入团。
先前的建议
临床医生科研经验交流及R语言介绍科研绘图投稿(第一个视频回顾)
临床医生进行科学研究并建立临床预测模型，以肝病论文为例(第二次视频回顾)
从事科学研究的临床医生董纪教授：倾向评分研究的临床路径和方法(第三篇综述)
